因縣境位于南充之西，加之古有西充國名，治內有西充山，故名西充。

據西充地方史志記載，早在四五千年以前，嘉陵江南充區河段內的先民們，就在西充這塊古老的土地上繁衍生息，他們不僅與中原民族有著較為密切的聯系，而且創造了中原遠古文明所含的地方文化。創造這種文化的先民為“百濮”等族。

大約公元前21世至公元前771年（夏、商、西周），相傳禹分天下為九州，縣境隨四川皆屬梁州。殷商、西周時，又將梁州并入雍州，縣境隸雍州。

約公元前5世紀，居住在今湖北清江流域的巴族之一的稟君徙入川東地區，建立巴國，縣境隸巴國。巴子建國以后，繼遭秦楚夾擊，政治中心相繼由江州（今重慶）、墊江（今合川）遷到閬中。戰國時，縣境仍為巴國地。

公元前316年（周慎王五年），秦滅巴、蜀后建立巴郡和蜀郡。從此，縣境隸巴郡閬中縣。

公元前200年，劉邦稱漢中王，巴地遂為漢有。西漢王朝建立以后，即以將軍紀信（西充紫巖人）“誑楚存漢”之功，分閬中縣置安漢縣，繼又分閬中縣置充國縣（東漢初并入閬中縣，后復置）。從此縣境分別隸巴郡的充國縣和安漢縣。

蜀漢時期，縣境隸巴西郡的西充國縣與安漢縣。

公元266年（西晉泰始二年）分益州，置梁州，縣境遂隸梁州巴西郡的西充國縣和安漢縣。

公元431年（劉宋元嘉八年）改巴西郡為北巴西郡，縣境隨安漢縣、西充國縣隸此。梁王朝建立后，縣境分別隸巴州南宕渠郡的安漢縣和北巴州木蘭郡的西充國縣。

公元553年（西魏元欽二年），改南梁北巴州為隆州，縣境隸隆州金遷郡的晉城縣與南宕梁郡的安漢縣。

公元583年（隋開皇三年），文帝改郡為州，實行州、縣二級制，以安漢縣、晉城縣隸隆州。公元589年（開皇九年）改安漢縣為南充縣，縣境隸隆州的晉城與南充縣。

公元621年（唐武德四年）分南充、相如二縣置果州。同年又析果州的南充、隆州（閬州）的南部和梓州鹽亭置西充縣，隸果州。因縣境位于南充之西，加之古有西充國名，治內有西充山，故名西充。

公元1912年—1949年（中華民國），西充先后隸順慶府、川北道、四川省第十一行政督察區。

公元1949年10月1日，中華人民共和國成立。12月14日，西充和平解放。1950年1月西充隸西南區川北行署區南充專署。1952年9月1日恢復四川省建制，西充隸四川省南充專區。1968年，隸四川省南充地區。1993年9月改南充地區為南充市后，隸四川省南充市。